نظام مراقبت مرگ کودکان 59-1 ماهه از سال 1386 در کلیه دانشگاه های علوم پزشكي به اجرا درآمده است. اين نظام با هدف كلي كاهش مرگ ومير كودكان از طريق بررسي تاريخچه هر مورد مرگ کودک از زمان بروز اولین علامت خطر تا فوت تلاش مي كند با شناخت عوامل مساعد كننده و قابل مداخله مرگ كودكان ، با تهيه اقدامات مداخله اي آنها را كنترل نموده و يا اثر آنها را كاهش دهد.
توجه به سلامت کودکان به ویژه کودکان زیر 5 سال از مهم ترین راهبردهای نظام سلامت بوده ومرگ و ميركودكان زير 5 سال نیز از مهم ترين شاخص هاي توسعه و سلامت كشور در سطوح ملي و بين المللي است كه با انجام مداخلات لازم قابل پيشگيري مي باشد. این ویژگی در تدوین اهداف توسعه هزاره و پایدار نیز مشهود است.